医学微生物学课程主要包括医学细菌学、医学病毒学和医学真菌学三部分，其中医学细菌学和医学病毒学为主要的教学内容。医学细菌学和医学病毒学又分别包括医学细菌学基础和临床细菌学、医学病毒学基础和临床病毒学两部分，共计72学时。知识模块和教学对应的学时安排如下：

理论课部分    计45学时

医学细菌学                                                 22学时

医学细菌学基础                                     10学时

临床细菌学                                             12学时

医学病毒学                                                 22学时

医学病毒学基础                                      8学时

临床病毒学                                             14学时

医学真菌学                                                 1学时

具体内容如下：

1.绪论、细菌的形态与结构

2.细菌的生理学与细菌分类概述

3. 细菌的遗传与变异

4. 细菌的感染与抗菌免疫

5.细菌感染的检查方法、抗细菌治疗和细菌耐药性

6.球菌

7.肠杆菌科1：志贺菌与沙门菌

8.肠杆菌科-2：大肠埃希菌；弧菌、螺杆菌

9. 厌氧性细菌

10. 分枝杆菌

11.螺旋体、立克次体、支原体、衣原体

12.病毒的形态与结构、病毒分类概述

13. 病毒增殖、病毒遗传和变异

14.病毒的感染与抗病毒免疫

15.病毒感染的检查方法与防治策略

16.呼吸道病毒

17.肠道病毒、急性胃肠炎病毒

18.肝炎病毒

19.逆转录病毒

20.疱疹病毒及肿瘤相关病毒

21.虫媒病毒和出血热病毒

22.狂犬病毒，其他病毒、朊粒

23.病原性真菌

实验教学部分    计27学时

    实验教学分八次完成。除实验一、四、六为4学时外，其它实验均为3学时。我们在实验教学内容、形式上较以往安排作了较大改革，除安排的基本教学内容之外，对于部分学生进行“实验拓展项目”的学习（该部分内容在“实验教学”中予以详细说明）。