基因组学

“基因组学”课程思考题
发布时间: 2012-02-23 访问次数: 1217

基因组学课程思考题

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1)     RNADNA的主要区别是什么?为什么RNA不能成为主要的遗传信息载体?

2)     什么是C-值悖理?什么是N-值悖理?

3)     质粒DNA为何会产生超螺旋结构?

4)     什么是顺序复杂性? 如何计算顺序复杂性?

5)     单拷贝DNA和多拷贝DNA复性时具有何种动力学特征?

6)     RNA分子有哪些种类?

7)     非编码RNA包括哪些类型?

8)     什么是假基因?假基因是如何形成的?

9)     假基因能否表达? 为什么?

10)  如何划分基因家族? 什么是超基因家族?

11)  低等生物与高等生物基因组组成有何差别?为什么会产生这些差别?

12)  什么是蛋白质结构域(domain)? 什么是蛋白质模体(motif)? 这两者有什么差别?

 

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13)  什么是多态性? 多态性在遗传学研究中有何意义?

14)  有哪些分子标记? 各有什么特点?

15)  为什么会产生RFLP?

16)  如何将RAPD分子标记转化为RFLP标记?

17)  什么是SSR标记? SSR标记有哪些优点? 如何寻找SSR标记?

18)  什么是AFLP标记? AFLP标记与RFLP标记的主要区别是什么?

19)  什么是SNP? 如何寻找SNP? 同一位点有多少个SNP? 图解说明.

20)  什么是近等基因系(isogenic line)? 如何建立近等基因系?

21)  为何染色体上的不同区段遗传图标记有疏密之别?

22)  是什么原因造成染色体不同区段之间交换频率的差别?

23)  什么是重组热点?

24)  细菌染色体遗传图是如何绘制的?

25)  什么是系譜遗传作图? 如何确定系譜作图的可信度?

 

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26)  什么是基因组物理图? 物理图与遗传图有何不同?

27)  如何制备与分离大分子DNA?

28)  何谓限制性作图?

29)  要获得大片段DNA需要采用哪类限制性内切酶?

30)  什么是YAC载体? 它有什么优缺点? 请说明YAC载体各组成部件的功能?

31)  什么是BAC载体? 它有什么优缺点? 请说明BAC载体各组成部件的功能?

32)  什么是重叠群? 如何构建重叠群?

33)  STS作图依据的原理是什么?

34)  叙述辐射杂种作图的过程.辐射杂种作图的图距单位是如何确定的.

35)  什么是DNA指纹? 有哪些DNA指纹?

36)  如何采用DNA指纹绘制重叠群?

37)  什么是定位克隆? 如何进行定位克隆?

 

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38)  链终止法测序的原理是什么?

39)  DNA测序中采用的DNA多聚酶与细胞的DNA多聚酶有什么差别?

40)  鸟枪法测序与作图法测序有何差别?

41)  为何原核生物基因组更适合鸟枪法测序?

42)  图解说明BAC克隆测序与顺序组装的过程.

43)  为何BAC克隆测序和全基因组鸟枪法测序都会留下间隙?

44)  什么是物理间隙? 什么是顺序间隙? 如何填补这两类间隙?

45)  大型基因组鸟枪法测序的缺点是什么? 如何克服这些缺点?

46)  基因组鸟枪法测序要构建大小不同的插入片段克隆文库,原因何在?

47)  为何着丝粒区和近端粒区DNA的测序非常困难?

48)  有哪些方法可用来判断DNA顺序组装的正确与否?

49)  什么是甲基化过滤法测序? 为何玉米基因组测序要采取甲基化过滤测序?

 

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50)  简述原核生物和真核生物基因结构的特点与差别.

51)  什么是ORF? 在基因注释中ORF有何意义?

52)  什么是顺序同源性? 什么是顺序一致性? 什么是顺序相似性?

53)  什么是直系基因? 什么是平行基因? 它们的差别是什么?

54)  蛋白质结构域在基因注解中有何意义?

55)  何谓动物园杂交? 动物园杂交的依据是什么?

56)  基因注解中存在哪些困难与问题?

57)  注解基因可分为哪几类? 依据是什么?

58)  如何确定基因的边界?

59)  详述Ac-Ds转座子突变库的构建过程?

60)  什么是SAGE? 简述SAGE的操作过程.

61)  基因剔除的操作程序.

62)  有何方法可获得全长cDNA?

 

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63)  什么是核型?

64)  异染色质与常染色质的差别是什么?

65)  何谓SAR? 何谓MAR?

66)  什么是CpG? CpG岛有什么分布特点? CpG岛是如何产生的?

67)  比较遗传图与物理图的组成可以得到什么启示?

68)  叶绿体和线粒体基因组起源于原核生物的依据何在?

69)  真细菌和古细菌操纵子的组成有何差异?

70)  真核生物是否存在操纵子结构? 举例说明?

71)  什么是DNA转座子? 什么是RNA转座子(或逆转座子)? 这两类转座子的转座方式有何特点?

72) 果蝇P转座子的结构及其活化规律?

73) 基因组的扩张有哪些方式? 为何大基因组含有很高比例的逆转座子?

74) 逆转座子可分为哪几类? 各有什么特点?

75) 真核生物基因组串接重复顺序主要分布在哪些区域?

76) 什么是结构域重排? .

77) 线粒体基因组与叶绿体基因组在结构与组成上有何差异?

 

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78) 原核生物转录调控顺序的组成有何特点?

79) 什么是正调控? 什么是负调控?

80) 为什么衰减调控只出现在原核生物?

81) 原核生物RNA多聚酶如何识别不同的调控顺序?

82) 真核生物启动子结构的特点?

83) 真核生物有哪三类基因? 划分的标准是什?

84) 增强子的组成有哪些特点?

85) 什么是增强子组合调控? 增强子组合调控的生物学意义何在?

86) Pol III基因启动子的结构特征?

87) Pol II基因转录起始复合物的组成成员及其功能?

88) 转录因子结构的一般特点是什么? 请写出5种转录因子家族及其结构特征?

89) 酵母双杂交的工作原理?

90) 为什么说叶绿体基因和线粒体基因的转录方式与原核生物类似?

 

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91) 有哪些转录后加工与修饰的方式?

92) mRNA加帽的功能?

93) Poly(A)序列如何影响翻译起始?

94) 真核生物Poly(A)加尾信号与转录终止信号是否相同?

95) 简述mRNA前体剪接过程中发生的两次转脂事件。

96) 什么是可变剪接? 可变剪接的生物学意义?

97) 哪些突变会影响mRNA前体剪接方式的改变?

98) 内含子与外显子在组成上有何特点?

99) 是否所有RNA内含子的剪切均需蛋白质参与?举例说明.

100) 什么是反式剪接? 简述反式剪接的过程.

101) 成熟的rRNA需要经过哪些修饰? 细胞如何确保rRNA修饰位点的准确性?

102) 什么是RNA编辑? RNA编辑与RNA修饰有何不同?

103) 什么是siRNA? 什么是miRNA? 它们之间的差别是什么?

104) 简述miRNA的形成过程.

105) 解释RNAi的放大效应.

 

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106) 密码子有哪些特征? 这些特征有何生物学意义?

107) 原核生物与真核生物翻译起始密码子的识别方式有何不同?

108) 翻译起始是基因表达调控的一个重要环节, 有那些翻译起始调控方式?

109) 蛋白质合成中rRNA催化多肽键形成的证据何在?

110) 有多少种蛋白质翻译后的修饰方法?

112) 什么原因造成蛋白质的错误折叠? 细胞如何阻止蛋白质的错误折叠?

113) 蛋白质折叠的场所及其折叠过程.

114) 什么是蛋白质的糖基化? 蛋白质糖基化在何处进行?

115) 细胞如何控制蛋白质的程序性降解?

116) 蛋白质降解与基因表达调控有何联系?

 

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117) 染色质DNA核酸酶超敏位点与低敏位点的差别是什么?

118) 什么是位置效应? 举例说明。

119) 基因组如何阻止相邻基因之间调控顺序的干扰?.

120) 什么是副突变?副突变是如何传递的?

121) 何谓基因组印记? 它是如何产生的?

122) 什么是表观遗传? 表观遗传包括哪些内容? 举例说明.

123) 胚胎发育中基因组重新程序化出现在什么阶段?

124) 有什么实验证明DNA甲基化与基因的表达调控有关?

125) DNA甲基化与染色质重建有何联系?

126) DNA甲基化的生物学意义?

127) 核小体组蛋白有哪些修饰方式? 组蛋白修饰促使染色质松弛的原因是什么?

128) 失活X-染色体上的基因是否全部沉默? 举例说明。

129) 什么是剂量补偿? 果蝇与哺乳动物剂量补偿机制有何不同?

 

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130) 为何DNA拓扑学结构会影响DNA复制?

131) 真核细胞染色体复制是在哪个阶段发生的?

132) 有哪些证据表明DNA以半保守方式复制。

133) 真核生物染色体DNA复制是否在所有区段同时进行?

134) 什么是复制子?

135) 简述酵母复制起始点(ARS)的结构与功能。

136) 简述酵母DNA复制复合物的组装过程。

137) 为何会产生冈畸复制模式?

138) 真核生物与大肠杆菌清除冈畸片段引物的方式有何不同?

139) 列出大肠杆菌DNA复制叉上的主要成分, 它们各有什么作用?

140) 线性DNA末端复制会遇到什么问题? 通过何种方式解决?

141) 简述人类线粒体基因组的复制过程。

 

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142) 有哪些证据支持RNA世界假说?

143) 为何将现存生物分为三大类群?

144) 什么是2R假说? 有何证据说明2R假说是正确的?

145) 基因组主要通过什么方式增加基因的数目?

146) 新基因的产生有哪些主要方式?

147) 什么是外显子洗牌? 它在基因组进化中起什么作用?

148) 有什么方法可以判断基因组曾经发生过整体加倍?

149) 染色体倒位在物种进化中有何意义?

150) 人类Y染色体中反向重复结构有何生物学意义?

151) 简述转座子对基因组进化的影响。

 

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152) 什么是分子钟?为什么根据不同基因的变异获得的分子钟有很大差异?

153) 简述聚类理论的基本内容。

154) SNP等位型的组成有何特点?

155) 单倍型与连锁不平衡之间有什么联系?

156) 有哪些证据说明现代人起源于非洲古人类?

157) 为什么不同基因家族之间进化速率有很大差异?

158) 根据HOX基因家族的进化特点你可获得哪些启示?