华山医院传染病学科有着悠久的历史，创建于1956年，创始人为蜚声中外的著名临床医学专家戴自英教授，医术精湛并在医学界享有很高威望的感染病学家徐肇玥教授、刘裕昆教授、翁心华教授相继任传染病学科负责人，数十年来在诊治经典传染病及感染性疾病的医疗、教学、科研工作中已形成学科特色和优势，使国内重要的临床医疗中心之一。
1981年获准为国家教委首批博士点，1989年为国家教委首批重点学科，1996年进入国家教育部211重点工程，2001年评为国家重点学科，2005年被评为上海市医学重点学科。
本学科长期以来一直承担着复旦大学医学院本科生、研究生传染病学的教学任务，也承担了大量的实习医生、进修医生的培训任务。近5年来共培养博士生19名，硕士生15名；目前在读博士生9名，硕士生20名。每年接受来自全国的进修人员8-12名。同时承办全国性医学继续教育项目3项：感染性疾病诊治的新理论新进展，已开办十余年，每年举办2-3期，每期参加人数60-150人；感染病诊治新理论新进展，近五年举办4次，每次40人左右；感染性疾病病原学诊断的新技术和新进展，每年举办一次，每次参加人数40人左右。2006年被国家医学委员会批准为专业医师培训基地。
现科室所有专业人员包括教授（主任医师）、副教授（副主任医师）27名，博士生导师12名，硕士生导师10名，具博士学位者20名。其中大部分医生都有国外进修，从事博士后工作经历。有多名教授、副教授在各种学术组织中担任重要地位。既拥有一批全国知名的老专家，也拥有一批在学术界相当活跃并已有一定知名度的中青年教授，已形成一支高学术水平的人才梯队。
本科室现有授课教师共13人，其中教授4人，副教授4人，主治医师5人，分别承担不同的授课内容，可以说本学科师资力量雄厚，有丰富教学及人员培训经验。
