| 类型 | 名称 | 网址 |
| 药学信息数据库 | PharmaProjects | http://pharmaprojects.com/terms.htm 新药开发动态的商业资源 |
| Ensemble | http://ensemble.prous.com/ensemblesql/ensemblesql.asp 介绍处于不同研究阶段的活性化合物 |
| Daily Drug News | http://www.dailydrugnews.com/ess/today.com/ess/today.cfm 每日药物新闻 |
| Scrip | http://www.pjbpubs.com/scrip/index.htm 世界制药信息 |
| Pharm. Market Letter | http://www.marketletter.com/pharmamarketletter.htm 药物市场快报 |
| Thomson PharmaSM | http://www.thomsonScientific.com 全球综合性药学信息 |
| CRC理化手册 | http://www.hbcpnetbase.com |
| 综合化学辞典 | http://ccd.chemnetbase.com |
| 药物化学大全 | http://www.mdli.com/cgi/dynamic/product.html |
| 马丁代尔药典 | http://www.medicinescomplete.com/mc/index.htm |
| ScienceDirect | http://www.sciencedirect.com/science/journals 基于Web的电子期刊全文检索系统 |
| Wiley InterScience | http://www3.interscience.wiley.com |
| Springer Link | http://www.springerlink.com/home/main.mpx |
| ACS | http://pubs.acs.org/about.html |
| PubMed | http://www.pubmed.gov 全球最大的生物医学文摘 |
| Enbase | http://info.embase.com/embase_com/about/index.shtml 荷兰医学文摘 |
| 国际药学文摘 | http://scientific.thomson.com/products/ipa |
| 化学数据库 | MDL数据库 | http://www.mdli.com/ MDL公司提供CMC药物分子数据库（8165个化合物）和MDDR活性化合物数据库（118675个化合物），以及ACD－3D和ACD－SC数据库（化合物供应商产品目录，后者含超过200万个化合物，可用于虚拟筛选）。 |
| Beilstein Crossfire | http://www.crossfirebeilstein.com/index.shtml 最完整的有机化学数字资源 |
| CA 光盘 | http://www.cas.org/CAS100/index.html |
| SciFinder Scholar | http://www.cas.org/SciFinder/newfeatures.html 每天更新的在线数据库，专利文献是特色 |
| NCI数据库 | http://dtp.nci.nih.gov/ 美国国家癌症研究所（NCI）基于不同靶标筛选过的化合物目录约50万个，其中一半为免费，含相关活性数据，以化学结构及相关信息进行检索。 |
| PubChem | http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/ 小分子生物活性数据 |
| 化合物检索 (中文) | http://www.chemfinder.cn/ 采用常用物质名称、CAS编号或分子量，分类检索如下数据库：常用物质性质数据库；危险物品及其毒性数据库；热力学数据库；光谱能谱数据库；天然药物数据库 |
| ChemFinder | http://chemfinder.cambridgesoft.com/ 可采用化合物名称、CAS编号、分子式或者分子量分类检索多个化合物数据库，包括反应数据库。有些数据库检索是收费的。 |
| ZINC | http://zinc.docking.org/ 免费的可供虚拟筛选使用的商用化合物数据库，含有超过460万个化合物的三维结构 |
| Drug Bank | http://redpoll.pharmacy.ualberta.ca/drugbank/ 药物与相关靶标信息 |
| eMolecules | http://www.emolecules.com/ 集合化学品供应商提供的分子结构，以文本或结构式方式检索化合物结构及供应商信息，还可按类型检索。 |
| ASINEX | http://www.asinex.com/about.html 组合化学样品库 |
| synopsys | http://www.synopsys.co.uk/ 提供药物和精细化合物服务 |
| SPORE | http://www.fiz-chemie.de/katalog/organic/ 组合化学和反应数据库 |
| 生物学数据库 | PDB | http://www.rcsb.org/pdb/ X－射线、NMR等实验方法测定的生物大分子三维结构数据库，主要为蛋白质及其复合物结构，也包括核酸等结构。 |
| SCOP | http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/ 蛋白质结构分类 |
| CATH | http://www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/cath_new/index.html 蛋白质结构分类数据库 |
| GenBank | http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.html DNA一级序列数据库（美国），提供5700多万各蛋白质的核酸序列 |
| EMBL | http://ebi.ac.uk/embl/index.html 核苷酸序列数据库，包含序列名称、物种、序列长度、启动子、分类以及核酸序列（德国/英国） |
| DDBJ | http://www.ddbj.nig.ac.jp/ DNA数据库（日本） |
| SWISS-PROT | http://www.expasy.org/sprot/ 包含了超过12万个蛋白质序列，4500多万个氨基酸。此外还提动了蛋白质功能等具有很高价值的注释信息 |
| PIR | http://pir.georgetown.edu/ 目前最大的公共蛋白质序列库 |
| | KDBI | http://bioinf.xmu.edu.cn/databases/kdbi/search.php 分子相互作用动力学数据库 |
| | TTD | http://xin.cz3.nus.edu.sg/group/cjttd/TTD_ns.asp 药物靶点数据库 |
| | DART | http://xin.cz3.nus.edu.sg/group/drt/dart.asp 副作用相关蛋白数据库 |
