本课程将通过讲述人体共生微生物和微生态学的基本概念和基本知识、人体微生态的组成、正常微生物菌群与宿主和环境之间的关系等，让学生了解微生态的平衡对宿主的生理、营养和免疫的重要意义，并从中学习益生菌、益生元和合生元对调节失调的微生态来保持人体的健康的重要性。同时在教学过程中大量引入学科前沿知识动态和学术研究成果，拓展学生的视野，把研究性教学理念融入本科教学过程，培养适应时代要求高素质的创造型医学人才。课程安排如下：

一、人体共生微生物的概念、演化及组成

二、共生微生物与健康的关系、研究方法、发展和前景

三、营养、免疫和感染微生态学

四、分子生态学及其研究方法

五、人体的细菌手册

六、健康皮肤与病态皮肤

七、口腔小生境与龋齿

八、幽门螺杆菌与胃部健康

九、慢性病的肠原学说

十、是敌是友：多行拟杆菌与脆弱拟杆菌

十一、乳酸杆菌、加德纳尔菌、阴道线索细胞以及女性健康